Creada en 2002, COMSA Rail Transport es la empresa de COMSA EMTE dedicada a la logística y al transporte ferroviario.

COMSA Rail Transport fue la primera empresa española privada en obtener la licencia de Empresa Ferroviaria, requisito que junto con el Certificado de Seguridad obtenido en el 2007, le ha permitido convertirse en una de las empresas de referencia en el proceso de liberalización del sector ferroviario.

COMSA Rail Transport ofrece transporte de mercancías por ferrocarril, y servicos de consultoría en ingeniería del transporte, además de ser proveedores de tracción (construcción y mantenimiento). SIF, por su parte, ofrece servicios auxiliares, adicionales y complementarios en terminales ferroviarias.